Le virus est un agent infectieux de très petite taille sans métabolisme propre, constitué par une, parfois plusieurs nucléoprotéines (composés d’acide nucléique et de protéine), assurant le message génétique (noyau d’acide nucléique) protégé d’une coque de protéine (capside).
Les critères de classification des phytovirus ont évolué avec les techniques moléculaires : les propriétés pathogènes et la morphologie des particules virales (isométriques avec ou sans enveloppe, tubulaires, filamenteuses) ont été remplacées par des caractéristiques relatives à la structure et à la composition chimique des virions et de leur génome (virus à ARN ou à ADN, simple ou double brin).